红河州疾病预防控制中心是红河州人民政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益性事业单位。中心主要承担疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究七大公共卫生职能。中心占地12亩，建筑面积为3248.39平方米的实验综合楼和4745.4平方米的综合业务办公楼。根据职能中心内设12个科室（正科级），分别为办公室、总务科、卫生科、免疫规划科、艾滋病防治科、结核病防治科、寄生虫病防治科、地方病防治科、急性传染病防治与突发公共卫生事件处置科、卫生检验中心、慢性非传染性疾病防治科、健康教育科。设有14个专业实验室：即理化实验室、卫生微生物学实验室、病原微生物学实验室、艾滋病初筛实验室、艾滋病确认实验室、CD4细胞检测实验室、鼠疫强毒室、流感监测网络实验室、分子生物学实验室、血清学实验室、生化实验室、免疫实验室、结核病实验室和寄生虫病实验室。按照病原微生物分类管理要求，设有4个负压生物安全二级实验室、5个生物安全二级实验室、1个百级洁净实验室。
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