我州于2003年开始开展“三品一标”农产品质量认证工作,目前,全州共有184家企业278个产品获得“三品一标”认证,近5年的产品认证数量年均增长6%。
截至2017年底,全州有效使用绿色食品标志的企业共有30家,产品总数达到46个,创建绿色食品原料标准化基地46个,总面积达17.2万亩,现已开发的绿色食品包括水果、蔬菜、茶叶、白糖等4个品类;全州11个县市(不含金平县、河口县)共有37家企业34个产品获有机产品认证,有机生产面积10万余亩,认证产量6.2万吨。元阳县获批国家有机产品认证示范创建区,红河县获批国家级和省级有机产品认证示范创建区,石屏县获批省级有机产品认证示范创建区。