生态和环境保护事关人民群众居住环境和身体健康。“十五”以来，我州不断加大工业污染防治力度，在工业经济快速增长的同时，确保了污染物排放总量削减目标的实现，企业达标排放率显著提高。一是加大工业企业的结构调整力度，关停了一批能耗高、污染重的工业企业。二是加大污染治理力度。到2006年，全州有工业废水处理设施225套，处理工业废水近2亿吨，治理达标率达96.68％；有废气治理设施521套，治理能力达到1858.72万标立方米／小时；建成城镇污水处理厂4座，设计污水年处理量1729万吨。三是加强建设项目环境管理。全州环境影响评价制度执行率100%，“三同时”制度执行率为100%，否决了一批对水环境有影响的项目，严格控制新污染的产生。四是开展重点行业的污染综合整治，遏制了重点行业污染加重的势头，促进了局部地区环境质量的改善。五是核辐射与核安全管理得到加强，全州辐射环境、放射源装置有效控制，保障了广大人民群众身体健康。加大生态环境保护工作力度。目前，全州共建有各类自然保护区17个（国家级3个、省级4个、县市级8个），保护区总面积276647.4公顷，占国土面积的8.40%。“十五”期间累计造林287.9万亩(人工造林260.6万亩，飞播造林27.3万亩)，新增未成林地287.9万亩，郁闭后州内森林覆盖率可提高6.0%。全州累计封山育林332.7万亩。森林火灾次数、受害率、控制率、发生率均处于控制范围，连续十三年无重特大森林火灾。水污染综合防治取得成效，人民群众饮水安全得到保障。南盘江流域、红河流域污染物排放得到有效控制和削减。异龙湖、大屯海、长桥海、三角海、个旧金湖、蒙自南湖的水质得到了有效控制。